若手の会 ナイトタイムセミナー in 2016年度石川大会

「若手Rナイトフィーバー 1. ビッグデータの処理と植生データ解析」

お知らせ

2016/03/25 当日の発表資料,サンプルデータ2,サンプルコードを追加しました。
※発表資料は,当日,若干の変更があるかもしれません。


2016/03/24 参加予定の皆さまへ,当日のセミナーで使用するRソフトとパッケージ等を事前にインストールしていただくようお願いします。詳細は,ページ下部の説明をご覧ください。


2016/03/16 参加申込みを締め切りました。


2016/02/11 会場(石川県教育会館)の情報を更新しました。


2016/02/04 ナイトタイムセミナーin 2016年度石川大会の情報をアップしました。


趣 旨

 Rを使ったデータ解析企画の第二弾は,ざっくばらんな雰囲気を120%出せるようにナイトタイムセミナーを企画します。内容は,前回のアンケートでリクエストの多かった大量データ処理と植生データ解析の基礎が題材です。

 大量データ処理では,放牧家畜に取り付けたGPS首輪のデータをサンプルとして,数百ポイントを超えるGPS位置情報データのインポートから一日ごとの距離の計算,作図までを行う自分の関数を作成します。家畜の行動データに限らず,大きなデータの扱いにいつも時間をとられている学会員も多いはずです。自分の関数を作って,同じ処理を簡単に実行できるようにしましょう。

 植生データの解析は,草地学会員なら誰もが興味をもっている内容だと思いますが,被度や頻度のように定量的なデータ以外も扱うため,頭を悩ませている学会員も多くいると思います。前回の企画で学んだ一般化線形モデル(GLM)を活用して,植生データを解析してみましょう。

日時・会場

日時: 2016年3月30日(水)18:30-21:00

会場: 石川県教育会館 2F 第1会議室(金沢市香林坊1-240)[HP] [Map]

講演予定者

  • 1. 吉利怜奈 学生会員(広島大学)
    「Rでビッグデータを扱う~自分の関数を作ろう~」
    資料PDF | サンプルコード
  • 2. 安田泰輔 会員(山梨県富士山科学研究所)
    「(仮)植生データ解析~GLMを活用しよう~」
    資料PDF | サンプルコード

参加費

軽い食事をとりながら実習を行うため,参加費を徴収させていただきます。

社会人: 2000円

学 生: 無料

申込み方法

参加ご希望の方は,下記連絡先へ必要事項記入の上,3/15(火)までにご連絡ください。

連絡先:jsgs-wakate@naro.affrc.go.jp

記載事項:所属・氏名・メールアドレス


* 今大会ではランチタイムセミナーも企画しています。必ず「ナイトタイム企画参加」と明記してください。

事前準備:Rソフトとパッケージのダウンロード

当日のセミナーでお使いいただくRソフトのパソコンへのダウンロードに関しまして,Rソフトウェアと使用するパッケージ等を事前にパソコンへインストールしていただけますよう,お願いいたします。Rのサンプルコードおよびプレゼン資料は,後ほどアップロード(資料は,当日印刷したものを配布)する予定です。

【R本体】

CRAN: http://cran.r-project.org/

※インストール方法についてはこちら(RjpWiki)

パッケージ

(1) maptools

(2) glmmML

※パッケージのインストールには,Rソフト本体をインストール後に,ネットワークに接続された状態で以下のコマンドをタイプしてください。
  > install.packages("maptools")
  > install.packages("glmmML")

サンプルデータ

(1) 牛GPS首輪データ(CattleData.csv)| シェープファイル(RNFdataRY.zip

(2) 植生データと土壌硬度(soil_hardness.Rdata

テキストエディタ

Rソフトを利用するのに便利なテキストエディタを紹介します。こちらは必須ではありませんがインストールしておくと便利です。

【R Studio】

※Rソフト用の統合環境です。初心者にお勧めです。

- RStudioメイン(英語):http://www.rstudio.com/

- RStudioの紹介: http:/memorandum2015.sakura.ne.jp/index_rstudio.html
※ Open Source License (Free)のほうをインストール

【notepad++とnpp2r】

※高機能なテキストエディタnotepad++にRコマンドを直接送り込めるNppToRを入れておくと便利です。

- notepad++本家(英語):https://notepad-plus-plus.org/

- notepad++日本語版:https://osdn.jp/projects/notepad-plus/

- NppToR(英語):https://sourceforge.net/projects/npptor/

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